實(shí)時(shí)熒光定量PCR的優(yōu)化（五）

想要提高探針的的效果，可以考慮在探針上采用LNA（鎖核酸）堿基或MGB（小溝結合劑）基團。

這樣做的效果是：

1、增強探針與靶序列的雜交強度。增強結合的特異性后，背景噪聲降低，從而提高整個(gè)實(shí)驗的靈敏度。

2、一般為滿(mǎn)足設計要求，AT序列豐富的探針需要長(cháng)達40個(gè)核苷酸。通過(guò)LNA堿基或MGB的取代，可以將長(cháng)度減少至13～20個(gè)核苷酸，而不影響效果。

為什么這樣的方法可以提高探針的效果？

LNA堿基是一種核苷酸類(lèi)似物，其化學(xué)結構可以限制DNA構象為理想的Waston-Crick雙螺旋結構。每插入1個(gè)LNA堿基，可以使Tm值增加3～6°C。

MGB基團是一個(gè)能結合到DNA小溝的三肽分子，能與互補的單鏈DNA高特異性、高強度地結合。

例如SNP基因分型實(shí)驗，要求所有引物、探針復性溫度一致的多重PCR實(shí)驗，就很適合使用這個(gè)方法。