經(jīng)濟快捷的SNP位點(diǎn)研究方法-SNP基因分型

SNP，全稱(chēng) Single Nucleotide Polymorphisms，是指在基因組上單個(gè)核苷酸的變異。目前很多人仍然使用測序法來(lái)進(jìn)行研究，具有準確、直觀(guān)的優(yōu)點(diǎn)。但有一種方法，能間接的研究SNP，且經(jīng)濟快捷，那就是——SNP基因分型。

其實(shí)現原理：熔解溫度（melting temperature,Tm）是指吸光值增加到最大值的一半時(shí)的溫度稱(chēng)為DNA的解鏈溫度或熔點(diǎn)。當實(shí)時(shí)熒光定量PCR中的熒光探針與靶基因錯配，即靶基因序列上產(chǎn)生了核苷酸變異，他們的熔解溫度比較低。相對而言，沒(méi)有突變的靶基因與探針雜交的熔解溫度較高。通過(guò)區分熔解溫度的差異，來(lái)區分突變型和未突變型（野生型）。

進(jìn)行SNP基因分型需要注意：

1、將突變的位點(diǎn)放在探針中間。

2、保證兩條探針的熔解溫度相同。

熒光探針中，Taqman探針可進(jìn)行SNP基因分型。推薦Applied Biosystems公司的Taqman MGB探針，相對普通Taqman探針，與錯配序列的熔解溫度相差更大。

分子信標也可用于SNP基因分型。他的莖環(huán)結構比一般線(xiàn)性的分子探針更適合SNP分型，莖環(huán)結構與錯配序列雜交的熱穩定性更低，熔解溫度相差也更大。

讀者們可根據自己的實(shí)驗需求，選擇合適的方法進(jìn)行分析。